Egalement fortement concernés par la perte de biodiversité, les milieux côtiers et marins font l’objet d’actions de préservation et de restauration spécifiques : réimplantation d’espèces, réhabilitation d’habitats naturels (algues, herbiers…), création d’habitats artificiels sur ouvrages ou à proximité (ex. : nurseries artificielles en milieu portuaire), dispositifs de lutte contre l’érosion… Les pôles Mer Bretagne Atlantique et Mer Méditerranée mènent de nombreux projets de recherche dédiés à la protection des milieux côtiers et marins avec des partenaires publics et privés.